È stato dimostrato che la dieta a basso contenuto di FODMAP migliora la qualità della vita e i sintomi generali dell’IBS(sindrome del colon irritabile), inclusi dolore addominale, gonfiore, diarrea e flatulenza. Una dieta a basso contenuto di FODMAP a breve termine può anche ridurre il disagio gastrointestinale acuto (comunemente crampi e diarrea) associato a un intenso esercizio di resistenza. La dieta FODMAP è stata sperimentata, oltre ai pazienti che soffrono di IBS, per endometriosi, fibromialgia e SIBO(small intestinal bacterial overgrowth – sovracrescita batterica intestinale). In questi casi è stata valutata per le complicanze a carico intestinale dovuti alle patologie citate. Spesso in pazienti con endometriosi si hanno sintomi a carico intestinale, quindi una correlazione tra IBS ed endometriosi.